Klíčový rozdíl mezi lytickým a lysogenním cyklem bakteriofága spočívá v tom, že během lytického cyklu reprodukce bakteriofága je bakteriofág, který vstupuje do hostitelské buňky, přítomen jako samostatná složka bez integrace s hostitelskou DNA, zatímco v lysogenním cyklu je bakteriofágová DNA integrována do hostitelské DNA a odpovídajícím způsobem replikovat.
Bakteriofág je virus, který infikuje bakterie. Reprodukce bakteriofága probíhá dvěma mechanismy (cykly); lytický cyklus a lysogenní cyklus.