Klíčovým rozdílem mezi mitózou a binárním štěpením je to, že mitóza je typem jaderného dělení, které se vyskytuje v eukaryotických organismech za účelem produkce dvou identických dceřiných buněk z mateřské buňky, zatímco binární štěpení je typem nepohlavní reprodukce / dělení buněk, ke kterému dochází u prokaryotických organismy, aby se množily a zvyšovaly jejich počet.
Všechny formy života prokaryot a eukaryot musí mít nějaké prostředky k znásobení své základní stavební jednotky; „Buňka“bez ohledu na složitost jejich buněčné organizace. Tento proces je proto nezbytný pro růst a regeneraci v mnohobuněčných organismech, stejně jako pro nepohlavní reprodukci v některých jednobuněčných organismech. V tomto ohledu mají procesy obou, mitóza a binární štěpení, zřejmě podobný výsledek výroby dvou jednotek z jedné. Pečlivá a hloubková analýza obou procesů však odhalí výrazný rozdíl mezi mitózou a binárním štěpením.