Klíčový rozdíl mezi přechodným a vyváženým polymorfismem je založen na tom, jak se alely chovají. Přechodný polymorfismus je progresivní nahrazování jedné alely genu jinou alelou, zatímco vyvážený polymorfismus je udržování obou dvou alel genu v čase
Genetický polymorfismus je jedna nebo dvě nebo více variant konkrétní DNA. Přechodný a vyvážený polymorfismus jsou dva typy polymorfismu, které vznikají v důsledku dvou alternativních alel genu. V přechodném polymorfismu je ze dvou alternativních alel daného lokusu jedna alela postupně nahrazována druhou. Ve vyváženém polymorfismu jsou obě alely ve vzájemné rovnováze. Obě verze genu jsou v populaci zachovány.
