Klíčovým rozdílem mezi endotelem a mezotelem je to, že endotel je jednoduchá dlaždicová epiteliální buněčná vrstva, která lemuje celý oběhový systém včetně krevních cév, lymfatických cév a srdce, zatímco mezotel je jednoduchá dlaždicová epiteliální buněčná vrstva, která lemuje hlavní tělesné dutiny, jako je pobřišnice, pleura a perikard.
Epitel, mezotel a endotel jsou tři typy buněčných vrstev, které lemují naše vnitřní orgány, tělesné dutiny a kůži. Proto jsou všechny ochrannými bariérami těla. Strukturálně jsou mezotel a endotel specializované nebo modifikované epiteliální vrstvy s mezodermálním původem. Proto jsou tvořeny jednoduchými dlaždicovými epiteliálními buňkami. Mesothelium i endotel jsou jednovrstvé tkáně. Lemují určité vnitřní povrchy.