Klíčovým rozdílem mezi mikrofágem a makrofágem je, že mikrofág je typ malého fagocytů, který žije pouze několik dní, zatímco makrofág je typem většího fagocytů s delší životností.
Náš imunitní systém bojuje s napadajícími patogenními mikroorganismy a udržuje nás v bezpečí. Jedná se tedy o složitý systém, který provádí mnoho různých obranných mechanismů, aby detekoval útočníky a zničil je. Fagocytóza je jeden mechanismus, při kterém fagocyty pohlcují napadající částice a zabíjejí je. Fagocyty jsou buňky schopné pohlcovat a absorbovat bakterie a v nich se ničí další cizí buňky a infekční částice. V souladu s tím existují dva hlavní typy fagocytů, jmenovitě mikrofág a makrofág. Mikrofág je malý polymorfonukleární fagocyt, který se vyskytuje ve velkém počtu. Na druhou stranu je makrofág typem fagocytů, které jsou umístěny na několika důležitých místech v našem těle, aby fungovaly jako obranný mechanismus proti invazi částic. Jsou velkými jedlíci našeho imunitního systému.