Klíčovým rozdílem mezi trávením bílkovin v žaludku a tenkém střevě je to, že trávení bílkovin v žaludku probíhá pomocí pepsinu a kyseliny chlorovodíkové, zatímco trávení bílkovin v tenkém střevě probíhá pomocí trypsinu a chymotrypsinu vylučovaného slinivkou břišní.
Potraviny, které konzumujeme, podléhají chemickému a mechanickému trávení v zažívacím systému. Jakmile je jídlo stráveno, živiny se vstřebávají do našeho krevního oběhu tenkým střevem. Trávení bílkovin probíhá ve dvou fázích: v žaludku a v první části tenkého střeva (dvanáctníku) pomocí proteáz. V žaludku pepsin štěpí bílkoviny na aminokyseliny a oligopeptidy. Další trávení oligopeptidů na aminokyseliny, dipeptidy a tripeptidy probíhá v tenkém střevě pankreatickými enzymy.
