Klíčovým rozdílem mezi glykogenem a glukózou je, že glykogen je polysacharid, který ukládá sacharidy u zvířat a hub, zatímco glukóza je nejhojnější monosacharid, který funguje jako primární zdroj energie v buňkách.
Sacharidy jsou organické sloučeniny charakterizované prvky uhlíku, vodíku a kyslíku. Poměr vodíku k kyslíku je 2: 1 v uhlohydrátech, podobně jako u vody. Sacharidy jsou velmi důležité rozšířené biologické sloučeniny, protože jsou hlavním zdrojem energie a strukturní složkou protoplazmy. Obecně platí, že sacharidy jsou bílé, pevné a rozpustné v organických kapalinách s výjimkou určitých polysacharidů. Monosacharidy jsou základní jednotkou molekul sacharidů a glukóza je nejdůležitější z nich. Glykogen je také sacharid. Je to ale polysacharid, který se vytvoří anabolismem molekul glukózy na rozvětvenou molekulu. Jak glukóza, tak glykogen jsou důležité při výrobě energie v těle. Glukóza je hlavním palivem pro výrobu energie a glykogen je druh sekundárního,dlouhodobé skladování energie u zvířat a hub.
