Klíčový rozdíl mezi RQ a RER spočívá v tom, že RQ je přímé měření z krve a RER v nepřímém měření z dechu.
Kalorimetrie měří množství tepla uvolněného z metabolismu nebo výdeje energie. Metabolismus potřebuje kyslík a ten produkuje oxid uhličitý. Respirační kvocient (RQ) a Respirační směnný poměr (RER) jsou dvě kalorimetrická měření, která jsou podobná. RQ je však přímé měření odebrané z krve. Jedná se o metabolickou výměnu plynů, která se rovná produkci CO 2 při absorpci kyslíku (CO 2 / O 2). RER je nepřímé měření měřené dechem. Proto je RQ invazivní metoda, zatímco RER je neinvazivní metoda.