Klíčovým rozdílem mezi aloprotilátkou a autoprotilátkou je to, že aloprotilátka je protilátka produkovaná proti aloantigenům, což jsou cizí antigeny zavedené transfuzí nebo těhotenstvím. Autoprotilátka je mezitím protilátka, která reaguje s vlastními antigeny.
Protilátky jsou produkovány jako výsledek imunitní odpovědi. Mohou odrážet přítomnost, povahu a intenzitu imunitní odpovědi. Imunitní systém by měl být schopen samostatně identifikovat vlastní antigeny a cizí antigeny. Pro svou funkci je zásadní. B buňky imunitního systému produkují protilátky proti antigenům. Alloprotilátky a autoprotilátky jsou dva typy těchto protilátek. Alloprotilátky se produkují v důsledku zavedení aloantigenů do těla transfuzí nebo těhotenstvím. Naproti tomu autoprotilátky jsou protilátky, které reagují s vlastními antigeny. Reakce autoprotilátek s vlastními antigeny je zodpovědná za zánět, poškození a dysfunkci tkání a orgánů, což vede k známkám a příznakům autoimunitních poruch.
