siRNA vs miRNA
RNA jsou velmi důležité molekuly, které pomáhají budovat život organismů. Vědci nedávno objevili malé RNA nazývané RNA interference nebo RNAi, které po transkripci působí na kontrolu genové exprese. Dva hlavní typy malých RNA jsou mikro RNA nebo miRNA a malá interferující RNA nebo siRNA. Tyto molekuly v podstatě regulují genovou expresi potlačením cílového genu. Jak miRNA, tak siRNA mají velmi podobné dráhy biogeneze, i když mezi nimi existují určité rozdíly. Původ miRNA a siRNA pochází z molekul dsRNA. Zralé miRNA jsou strukturně podobné molekulám siRNA.
miRNA
Mikro RNA nebo miRNA jsou malé molekuly RNA, které zprostředkovávají závěrečnou kontrolu regulace translačního genu. Deregulace miRNA může vést k rozvoji rakoviny a dalších onemocnění. Proto je správná regulace informací kódovaných v nekódující oblasti miRNA velmi důležitá v mnoha základních buněčných procesech.
siRNA
siRNA se také označují jako krátká interferující nebo umlčující RNA a jsou tvořeny dvouvláknovou RNA s 20 až 25 páry bází. Hlavní rolí siRNA je interferovat s expresí specifických genů s komplementárními nukleotidovými sekvencemi. siRNA je tvořena krátkou dvouvláknovou RNA s fosforylovanými 5 'konci a hydroxylovanými 3' konci se dvěma převislými nukleotidy.
Jaký je rozdíl mezi siRNA a miRNA?
• miRNA pocházející ze specifických genomových lokusů, zatímco siRNA pocházející z mRNA, transpozonů, virů nebo heterochromatické DNA.
• Syntéza miRNA se zpracovává z delších prekurzorů vlásenkových transkriptů (primární nukleární miRNA sekvence endonukleázou RNázy III), zatímco syntéza siRNA se zpracovává z dlouhých bimolekulárních duplexů RNA.
• Každá miRNA vlásenková prekurzorová molekula produkuje jeden miRNA duplex, zatímco každá prekurzorová molekula siRNA produkuje více duplexů siRNA.
• sekvence siRNA jsou zřídka konzervované, zatímco sekvence miRNA jsou dobře konzervovány.
• Všechny báze v siRNA přispívají k její cílové specificitě, zatímco pouze 5 'polovina miRNA přispívá k její cílové specificitě.
• miRNA se často váže na 3 'nepřekládanou oblast cílových transkriptů, zatímco siRNA tvoří komplementární duplex kdekoli podél cílové mRNA.
• miRNA specifikuje „hetero- umlčení“, zatímco siRNA se používá pro „automatické umlčení“.
• miRNA působí jako signál k zabránění translace, zatímco siRNA fyzicky brání translaci.
