Klíčovým rozdílem mezi fotobiontem a mykobiontem je, že fotobiont označuje fotosyntetickou složku lišejníku, což je zelená řasa nebo sinice, zatímco mykobiont označuje houbovou složku lišejníku, což je hlavně ascomycete nebo basidiomycete.
Mezi živými organismy existují symbiotické vztahy. Symbiotický vztah je sdružení, ve kterém spolu žijí dva různé druhy organismů. Parazitismus, vzájemnost a komenzalismus jsou navíc tři typy symbiotických vztahů. Mutualismus je přínosem pro obě strany. Lichen je takový druh vzájemné asociace, která existuje mezi řasami / sinicemi a houbami. V tomto sdružení je jedna strana odpovědná za výrobu potravin fotosyntézou, zatímco druhá strana je odpovědná za absorpci vody a poskytování přístřeší. Na základě toho je řasa / sinice známá jako fotobiont, který provádí fotosyntézu, zatímco houba je známá jako mykobiont, který poskytuje úkryt a absorbuje vodu.
