Klíčovým rozdílem mezi genetickou mapou a spojovací mapou je typ genů použitých pro proces mapování. Genetická mapa se skládá ze všech genů přítomných na konkrétním chromozomu, zatímco vazebná mapa se skládá ze spojených genů přítomných na konkrétním chromozomu.
Genetická mapa a vazebná mapa jsou dva typy chromozomálních map, které ilustrují geny nalezené na chromozomech. Genetická mapa zobrazuje všechny geny, zatímco mapa propojení zobrazuje pouze spojené geny. Oba jsou velmi užitečné při diagnostice genetických chorob a poruch. Kromě toho lze chromozomální aberace detekovat také pomocí genetických a vazebných map. Propojené mapy dále poskytují představu o vývoji konkrétních genů.