Klíčovým rozdílem mezi poriny a aquaporiny je, že poriny jsou vodou vyplněné póry a kanály, které se nacházejí v membránách bakterií a eukaryot. Aquaporiny jsou zatím membránové proteiny, které v živých buňkách vytvářejí kanály selektivní k vodě.
Různé molekuly procházejí dovnitř a ven z buňky přes plazmatickou membránu v živých organismech. V plazmatické membráně tedy existují různé membránové proteiny, které udržují a regulují molekuly vstupující a vystupující z buněk. Poriny a aquaporiny jsou dva takové typy membránových proteinů. Z nich jsou poriny vodou plněné póry, které usnadňují transport hydrofilních molekul přes membránu. Mezitím aquaporiny jsou kanály selektivní pro vodu, které specificky umožňují vodě volně procházet přes membránu.
