Klíčovým rozdílem mezi mutagenem a teratogenem je to, že mutagen je látka nebo látka, která způsobí změnu v sekvenci DNA jedince, zatímco teratogen je látka, která během těhotenství poškozuje plod nebo vyvíjející se embryo.
Mutageny a teratogeny jsou obvykle chemické látky. Fyzikální a biologické látky však mohou také působit jako mutagen nebo teratogen. Obojí může u jednotlivců vést k velmi škodlivým nebo smrtelným účinkům. Zlepšení biotechnologie však přineslo nové poznatky o konceptech mutagenů i teratogenů.