Klíčovým rozdílem mezi funkční skupinou a substituentem je to, že funkční skupina je aktivní součástí molekuly, zatímco substituent je chemická látka, která může nahradit atom nebo skupinu atomů v molekule.
Pojmy funkční skupina a substituent se často vyskytují v organické chemii. Funkční skupina je specifický typ substituentu, který způsobuje aktivitu molekuly. To znamená, že reakce, které určitá molekula podstoupí, jsou určeny funkční skupinou. Substituentem však může být buď aktivní chemická látka, nebo neaktivní chemická látka.
