Klíčovým rozdílem mezi archenteronem a blastocoelem je to, že archenteron je primární střevo vytvořené během gastrulace ve vyvíjející se zygote, která se později vyvine do zažívací trubice, zatímco blastocoel je vnitřní dutina blastuly vyplněné tekutinou nebo žloutkem vytvořená během blastulace.
Hnojení je událost sexuální reprodukce, která tvoří diploidní zygotu. Zygota se nakonec promění v embryo. Embryo prochází mitotickými děleními a buněčnou diferenciací, čímž vzniká mnohobuněčné embryo. Morula je rané stádium embrya, které obsahuje 16 buněk. Morula se stává blastula v sedmém výstřihu. Blastula obsahuje 128 buněk. Je to dutá koule buněk obklopujících vnitřní dutinu naplněnou tekutinou. A tato tekutinou naplněná dutina blastuly je známá jako blastocoel. Blastula se sklopí dovnitř a zvětší se, aby se vytvořila gastrula, což je vícevrstvá struktura obsahující primární zárodečné vrstvy. Archenteron je primární střevo umístěné v gastrule. Archenteron se později vyvine do zažívací trubice.