Klíčovým rozdílem mezi mastigomycotinou a zygomycotou je, že mastigomycotina je polyphyletická skupina hub, které produkují bičíkovité buňky a mají rhizoidy, zatímco zygomycota je rozdělení hub, které během pohlavní reprodukce produkují charakteristické rezistentní sférické spory zvané zygospores.
Houby jsou vláknité eukaryotické organismy patřící k houbám království. Produkují sexuální i nepohlavní spory. Mohou to být saprofyty nebo paraziti. Existují různé druhy skupin hub. Mezi hlavní skupiny patří mastigomycotina, zygomycota, ascomycota, basidiomycota a deuteromycota. Mastigomycotina se skládá ze zoosporických hub, ve kterých jsou mnohé pouze vodní. Houby Zygomycota jsou konjugační houby, které produkují charakteristické zygospory. Houby Ascomycota jsou houby vaků, které produkují vakovitou strukturu zvanou ascus. Houby Basidiomycota produkují klubkovitou strukturu zvanou basidium. Houby Deuteromycota jsou houby nedokonalé, což znamená, že mají pouze bezpohlavní nebo myceliální stav.