Klíčovým rozdílem mezi radioaktivními a neradioaktivními sondami je, že radioaktivní sondy jsou jednovláknové sekvence DNA nebo RNA, které jsou značeny radioaktivními izotopy, zatímco neradioaktivní sondy jsou jednovláknové sekvence DNA nebo RNA, které jsou označeny chemickou značkou nebo fluorescenční značkou.
Hybridizace nukleových kyselin je důležitou technikou v molekulární biologii, zejména v mikrobiální diagnostice. Pomáhá identifikovat nebo detekovat konkrétní sekvenci nukleové kyseliny. V této technice jsou nukleové kyseliny fixovány na pevný povrch a hybridizovány sondou. Sonda je fragment DNA nebo RNA, který je komplementární k sledované sekvenci. Pokud je ve vzorku přítomna cílová sekvence, sonda s ní hybridizuje a učiní ji detekovatelnou. Existují dva typy sond jako radioaktivní a neradioaktivní sondy. Proto můžeme sondy označit radioaktivním tagem nebo fluorescenčním tagem.