Klíčovým rozdílem mezi konzervativní a konsenzuální sekvencí je, že konzervovaná sekvence označuje podobné sekvence nukleových kyselin nebo aminokyselin, které se vyskytují u různých nebo stejných druhů po celé generace, zatímco konsensuální sekvence je běžně se vyskytující nukleotidová sekvence nebo aminokyselinová sekvence nalezená ve vysoce konzervované oblasti DNA nebo RNA nebo proteinu.
Organismy sdílejí podobné i odlišné charakteristiky. Při studiu vztahů mezi organismy a jejich klasifikaci je velmi důležitý genom nebo genetická výbava organismů. Existují některé nukleotidové nebo aminokyselinové sekvence, které jsou běžné u různých organismů. Konzervovaná sekvence je sekvence nukleové kyseliny nebo aminokyseliny, která je konzistentní mezi druhy. Proto jsou při generování fylogenetických stromů fylogeneticky důležité. V konzervovaných sekvencích existují specifické nukleotidové sekvence, které se běžněji vyskytují. Jsou známy jako konsensuální sekvence.