Klíčovým rozdílem mezi aloštěpem a autograftem je, že aloštěp je kostní štěp odebraný od dárce (jiné osoby), zatímco autograft je kostní štěp odebraný samotnému pacientovi.
Allograft a autotransplantát jsou dva běžné typy lidských kostních štěpů používaných pro procedury podávání štěpů za účelem hojení kostních poranění. V závislosti na poranění chirurgové zvolí vhodný štěp pro operaci. Autograft pochází ze samotného těla pacienta, zatímco aloštěp pochází od dárce. Úspěšnost operace autotransplantátu je vyšší než u alotransplantátu. Kromě toho je riziko infekce také vysoké u operací štěpu než u autotransplantátů.