Klíčový rozdíl - gelová elektroforéza vs
Gelová elektroforéza je technika, která odděluje makromolekuly v elektrickém poli. V molekulární biologii je běžnou metodou separace DNA, RNA a proteinů ze směsí podle jejich molekulárních velikostí. SDS Page je typ gelové elektroforézy, který se používá k oddělení proteinů ze směsi proteinů na základě jejich velikostí. Gelová elektroforéza je termín používaný k označení běžné techniky používané pro separaci DNA, RNA a proteinů, zatímco SDS Page je jeden typ gelové elektroforézy. To je klíčový rozdíl mezi gelovou elektroforézou a SDS Page.
OBSAH
1. Přehled a hlavní rozdíl
2. Co je gelová elektroforéza
3. Co je SDS strana
4. Porovnání vedle sebe - gelová elektroforéza vs. SDS strana
5. Shrnutí
Co je gelová elektroforéza?
Gelová elektroforéza je běžná technika používaná v laboratořích k oddělení nabitých molekul, jako je DNA, RNA, bílkoviny atd., Od jejich směsí. Při gelové elektroforéze se používá gel. Působí jako molekulární síto. Při gelové elektroforéze se používají dva typy gelů, jmenovitě agaróza a polyakrylamid. Výběr gelu a gelového přípravku jsou důležité faktory, které je třeba vzít v úvahu při gelové elektroforéze, protože s velikostí pórů gelu je třeba opatrně manipulovat, aby došlo k dobré separaci molekul prostřednictvím gelové elektroforézy. Gelová elektroforéza má elektrické pole připojené ke dvěma koncům gelu. Jeden konec gelu vykazuje kladný náboj, zatímco druhý konec je záporně nabitý.
DNA a RNA jsou negativně nabité molekuly. Jakmile jsou vloženy do gelu ze záporného konce gelu a aplikovány na elektrické pole, migrují póry gelu směrem ke kladně nabitému konci gelu. Rychlost migrace závisí na náboji a velikosti molekuly. Menší molekuly snadno migrují gelovými póry než větší molekuly. Proto menší molekuly cestují přes gel na velkou vzdálenost a větší molekuly na krátkou vzdálenost. Ke sledování pohybu molekul na gelu se používají speciální typy barviv. Elektrické pole se aplikuje po určitou dobu a zastaví se, aby se zabránilo ztrátě molekul a aby se molekuly udržovaly v jejich pozicích. V gelu lze pozorovat různé pruhy. Tyto pásy představují molekuly různých velikostí. Proto,gelová elektroforéza je užitečná pro rozlišení molekul podle jejich velikosti.
Gelová elektroforéza je začleněna do různých technik jako přípravná technika v molekulární biologii, jako je PCR, RFLP, klonování, sekvenování DNA, Southern blot, mapování genomu atd.
Obrázek 01: Elektroforéza na agarózovém gelu
Co je stránka SDS?
Gelová elektroforéza s dodecylsulfátem sodným na polyakrylamidu (stránka SDS) je typ gelové elektroforézy používaný k oddělení proteinů. Když se k separaci proteinů používá gelová elektroforéza, je nutné speciální ošetření, protože proteiny nejsou negativně nabité jako DNA a RNA a nemigrují směrem k pozitivnímu nebo negativnímu konci. Proto jsou proteiny před gelovou elektroforézou denaturovány a potaženy negativním nábojem. Provádí se to pomocí detergentu zvaného dodecylsulfát sodný (SDS). Gelová elektroforéza, která používá SDS a polyakrylamidový gel pro nosné médium, je známá jako SDS Page. Tato technika se běžně používá v biochemii, genetice, forenzní a molekulární biologii.
Během SDS Page jsou proteiny smíchány s SDS. SDS rozkládá proteiny do lineárního tvaru a obaluje je záporným nábojem úměrným jejich molekulové hmotnosti. Kvůli negativnímu náboji migrují molekuly proteinu směrem ke konci gelu s pozitivním nábojem a oddělují se podle své molekulové hmotnosti. Na stránce SDS se polyakrylamid používá jako pevný podklad pro gel. Skutečná separace proteinů závisí hlavně na vlastnostech gelu. Příprava polyakrylamidového gelu by proto měla být pečlivě provedena a měly by být použity správné koncentrace polyakrylamidu. Polyakrylamidové gely vykazují vysoké rozlišení než agarózové gely. SDS Page je tedy považován za techniku s vysokým rozlišením pro separaci proteinů.
SDS Page je typ denaturační gelové elektroforézy. Má zásadní omezení v analýze bílkovin. Protože SDS denaturuje proteiny před separací, neumožňuje detekci enzymatické aktivity, vazebných interakcí proteinů, proteinových kofaktorů atd.
Obrázek 02: Stránka SDS
Jaký je rozdíl mezi gelovou elektroforézou a SDS Page?
Gelová elektroforéza vs SDS |
|
Gelová elektroforéza je metoda prováděná k oddělení makromolekul pomocí elektrického pole. | SDS Page je gelová elektroforéza s vysokým rozlišením používaná k separaci proteinů na základě jejich hmotnosti. |
Gel Run | |
Může být provedeno vodorovně nebo svisle. | Stránka SDS běží vždy svisle. |
Základ pro oddělení | |
K rozdělení dochází podle náboje a velikosti. | K separaci proteinů dochází podle hmotnosti a náboje. |
Řešení | |
Elektroforéza na agarózovém gelu má nízké rozlišení a polyakrylamidová gelová elektroforéza má vyšší rozlišení | Stránka SDS má lepší rozlišení. |
Denaturace | |
Gelová elektroforéza zahrnuje jak denaturační, tak nedenaturační techniky. | Stránka SDS denaturuje proteiny před separací. |
Shrnutí - Gelová elektroforéza vs. SDS
Gelová elektroforéza je běžná technika používaná pro separaci a analýzu DNA, RNA a proteinů na základě jejich velikosti a náboje. Existují dva hlavní typy gelové elektroforézy, jmenovitě elektroforéza na agarózovém gelu a polyakrylamidová gelová elektroforéza. Agarózové gely se používají hlavně k separaci nukleových kyselin; pokud je požadováno vyšší rozlišení, používají se polyakrylamidové gely. SDS Page je typ gelové elektroforézy běžně používaný k oddělení komplexních směsí proteinů. Je považována za techniku separace proteinů s vysokým rozlišením. To je rozdíl mezi gelovou elektroforézou a SDS Page.