Klíčovým rozdílem mezi virem a prionem je, že virus je malá infekční částice složená z nukleových kyselin a proteinového obalu, zatímco prion je malá infekční částice složená z jediného proteinu.
Mikrobiologové studují různé typy biologických entit. Mezi nimi jsou virus a prion dva typy acelulárních infekčních částic. Nejsou považovány za živé organismy, protože vykazují více neživých vlastností než živých. Podobně neobsahují ribozomy a enzymy pro syntézu proteinů. Proto potřebují k množení živý organismus (hostitele). Navíc je nelze pozorovat pod světelnými mikroskopy a nelze je odfiltrovat Chamberlandovými filtry. Navíc nejsou kultivovatelné v živných médiích. Rozdíl mezi virem a prionem je hlavně kvůli jejich složení. Viry se skládají z nukleových kyselin a proteinů, zatímco priony se skládají pouze z proteinů. Podobně existuje několik rozdílů mezi virem a prionem, o nichž bude tento článek diskutovat.