Klíčovým rozdílem mezi virem a viroidy je, že virus je obligátním parazitem složeným z genomu RNA nebo DNA a proteinové kapsidy, zatímco viroidy jsou infekční částice složené z jednovláknových kruhových molekul RNA.
Existují různé typy infekčních agens, které způsobují onemocnění rostlin, zvířat a jiných organismů. Mezi nimi jsou dobře známé infekční agens bakterie, houby, prvoky, viry, viroidy a priony. Viry a viroidy jsou velmi malé částice. Oba typy jsou obligátní paraziti. Virus zahrnuje genom RNA nebo DNA obklopený proteinovou kapsidou. Viroidy jsou však jednovláknové kruhové molekuly RNA. Neobsahují proteinové kapsidy. Podobně existuje mnoho významných rozdílů mezi virem a viroidy. Tento článek se proto zabývá zkoumáním rozdílu mezi virem a viroidy.