Klíčový rozdíl - RNASE A vs RNASE H
Ribonukleázy jsou nukleázy, které specificky degradují RNA na menší jednotky. Lze je rozdělit do dvou kategorií; endoribonukleázy a exoribonukleázy. Endoribonukleáza je endonukleáza, která může degradovat jednovláknovou nebo dvouvláknovou RNA. Štěpí fosfodiesterové vazby v polynukleotidovém řetězci RNA. Jako příklady lze uvést RNázu A, RNázu III, RNázu T1, RNázu P a RNázu H. Exoribonukleáza je exonukleáza, která degraduje RNA odstraněním koncových nukleotidů buď z 5 'konce, nebo 3' konce molekuly RNA. Příklady jsou RNáza R, RNáza II, RNáza D a RNáza PH. Klíčovým rozdílem mezi RNASE A a RNASE H je to, že RNáza A je pankreatická ribonukleáza, která specificky degraduje jednovláknovou RNA na menší složky, zatímco RNáza H je nespecifický enzym, který štěpí RNA v hybridu RNA-DNA na menší jednotky prostřednictvím hydrolytický mechanismus.
OBSAH
1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co je RNASE A
3. Co je RNASE H
4. Podobnosti mezi RNASE A a RNASE H
5. Porovnání vedle sebe - RNASE A vs RNASE H v tabulkové formě
6. Shrnutí
Co je RNASE A?
RNáza A je pankreatická ribonukleáza, která specificky štěpí nepárové zbytky cytosinu a uracilu na 3 'konci jednovláknové RNA. RNáza H pracuje při vyšší koncentraci soli (0,3 M nebo vyšší koncentrace NaCl). Hydrolytická reakce probíhá ve dvou krocích. Tvoří 3 'fosforylovaný produkt prostřednictvím 2', 3 'cyklického monofosfátového meziproduktu. Ačkoli je specifický pro jednořetězcovou RNA při vyšší koncentraci solí, může také degradovat dvouřetězcovou RNA a RNA v hybridu RNA-DNA při nižší koncentraci NaCl (nižší než 0,3 M NaCl).
Bruce Merrifield nejprve syntetizoval tento enzym. RNáza A je velmi populární enzym v molekulárním výzkumu. Bovinní pankreatická RNáza A je příkladem RNázy A. A je to jeden z nejtvrdších enzymů, které se používají v laboratoři. Tento enzym nepotřebuje pro svoji aktivitu kofaktor. Je to vysoce termostabilní enzym. RNáza A je první enzym a třetí protein, u kterého byla detekována správná aminokyselinová sekvence. Tento enzym je velmi malý se 124 aminokyselinami a molekulovou hmotností 12600da. A má čtyři zbytky histidinu (His 12 a His 119, které se účastní katalytické reakce).
Obrázek 01: RNáza A
RNázu A lze izolovat vařením surového vzorku. Když se vaří, všechny ostatní enzymy degradují zbývající RNázu A. RNáza A je neuvěřitelně stabilní enzym. Tento enzym inhibuje s komplexy proteinu inhibitoru ribonukleázy, komplexů těžkých kovů a uridin-vanadátu.
Co je RNase H?
RNáza H je nespecifický ribonukleázový enzym, který může hydrolytickou reakcí degradovat RNA v hybridu RNA-DNA. RNáza H štěpí 3'- OP vazbu RNA v hybridu RNA-DNA. Nakonec produkuje produkty zakončené 3'OH a 5 'fosfátem. Při replikaci DNA hraje klíčovou roli odstraněním RNA primeru po vytvoření nových řetězců DNA. V laboratorních podmínkách specificky degraduje RNA v hybridu RNA-DNA, ale ne DNA a nehybridizovanou RNA. A tento enzym se obvykle používá ke zničení templátu RNA poté, co se během syntézy cDNA vytvoří první komplementární řetězec DNA.
Obrázek 02: RNáza H
RNáza H se také používá v testech ochrany nukleázou. Může být také začleněn do odstranění ocasu poly A z mRNA. RNáza H má schopnost ničit nekódující RNA uvnitř i vně buňky. Kovové ionty jsou vyžadovány jako kofaktory pro tuto aktivitu proteinu. Chelátor (EDTA) lze použít k inhibici enzymu RNázy H.
Jaké jsou podobnosti mezi RNASE A a RNASE H?
- Oba jsou proteinové povahy.
- Oba jsou endoribonukleáza
- Oba mohou degradovat RNA.
- Oba provádějí hydrolytické reakce.
- Molekulární laboratoře používají obojí.
Jaký je rozdíl mezi RNASE A a RNASE H?
Rozdílný článek uprostřed před tabulkou
RNASE A vs RNASE H |
|
| RNáza A je pankreatická ribonukleáza, která specificky štěpí 3 'konec nepárového zbytku cytosinu a uracilu jednovláknové RNA při vyšší koncentraci soli. | RNáza H je nespecifický ribonukleázový enzym, který může hydrolytickou reakcí degradovat RNA v hybridu RNA-DNA. |
| Povaha štěpení RNA | |
| RNáza A specificky štěpí jednořetězcovou RNA při vyšší koncentraci soli. | RNáza H štěpí RNA v hybridu RNA-DNA. |
| Potřeba kofaktorů pro aktivitu | |
| RNáza A nepotřebuje pro svoji aktivitu kofaktory. | RNáza H potřebuje pro svoji činnost ionty kovů jako kofaktory. |
| Inhibitory aktivity proteinů | |
| Komplexy proteinu inhibitoru ribonukleázy, komplexů těžkých kovů a uridin-vanadátu inhibují aktivitu RNAsy A. | Chelatátor (EDTA) inhibuje aktivitu RNázy H. |
| Odstranění RNA primeru při replikaci DNA | |
| RNáza A se nepoužívá k odstraňování primerů RNA při replikaci DNA. | RNáza H se používá k odstranění RNA primeru při replikaci DNA |
| Odstranění DNA šablony v syntéze komplementární DNA (C-DNA) | |
| RNáza A se nepoužívá k odstranění templátu RNA během syntézy komplementární DNA (C-DNA). | RNáza H se používá k odstranění templátu RNA během syntézy komplementární DNA (C-DNA). |
| Odstranění Poly-A-Tail v mRNA hybridizované na oligo (dt) | |
| RNáza A se nepoužívá k odstranění „poly-A ocasu“v mRNA hybridizované s oligo (dt). | RNáza H se používá k odstranění „poly-A ocasu“v mRNA hybridizované s oligo (dt) |
Shrnutí - RNASE A vs RNASE H
Ribonukleázy jsou nukleázové enzymy, které mají schopnost štěpit RNA na menší jednotky. Jsou to dva typy; endoribonukleázy a exoribonukleázy. Endoribonukleáza je endonukleáza, která má schopnost degradovat jednovláknovou nebo dvouvláknovou RNA. A štěpí fosfodiesterovou vazbu v RNA polynukleotidovém řetězci. RNáza A a RNáza H jsou dvě endoribonukleázy. RNáza A je pankreatická ribonukleáza, která specificky štěpí nepárové zbytky cytosinu a uracilu na 3 'konci jednořetězcové RNA při vyšší koncentraci soli. RNáza H je nespecifický ribonukleázový enzym, který může hydrolytickou reakcí degradovat RNA v hybridu RNA-DNA. To je rozdíl mezi RNázou A a RNázou H.
Stáhněte si PDF RNASE A vs RNASE H
Můžete si stáhnout verzi tohoto článku ve formátu PDF a použít jej pro offline účely podle citace. Stáhněte si zde PDF verzi. Rozdíl mezi RNASE A a RNASE H
