Klíčový rozdíl mezi GFP a EGFP spočívá v tom, že GFP je protein divokého typu zabudovaný do molekulárního klonování buněk, které nejsou savci, zatímco EGFP je vylepšený nebo upravený typ GFP, který lze použít na buňkách savců.
Molekulární klonování je pokročilá technika, kterou vědci nesmírně používají při expresi proteinů pomocí rekombinantní technologie. V technologii rekombinantní DNA je nutné úspěšně transformovat rekombinantní vektor na hostitelský organismus. Během procesu transformace by tedy mělo být identifikováno a potvrzeno, zda byl požadovaný gen transformován na hostitele či nikoli. Aby to mohli posoudit, molekulární biologové používají několik technik. Z těchto technik je jednou reportérový gen. Tyto reportérové geny fungují jako selekční markery pro výběr správných transformantů. Zelený fluorescenční protein (GFP) a Enhanced Green Fluorescent Protein (EGFP) jsou tedy dva reportérové proteiny používané při molekulárním klonování.
