Klíčový rozdíl mezi nefridiemi a malpighianskými tubuly závisí na jejich výskytu v organismech. Nephridia jsou přítomny v nižších organismech, jako jsou červi a měkkýši, zatímco malpighianské tubuly jsou přítomny v zadních oblastech hmyzu a suchozemských členovců.
Vylučování je důležitým aspektem živých organismů. Metabolické dráhy generují různé vylučovací produkty jako vedlejší produkty. Hromadění odpadu v systému živého těla je však toxické a škodlivé. Proto je nezbytná přítomnost mechanismu odstraňování metabolického odpadu z těla systémem vylučování. Proto jsou v různých skupinách organismů přítomny různé typy vylučovacích orgánů. Nephridia a malpighian tubules jsou dva příklady takových vylučovacích orgánů.
