Klíčovým rozdílem mezi oomycety a zygomycety je, že oomycety neobsahují chitin na svých buněčných stěnách, místo toho obsahují celulózu, beta glukany a aminokyselinu hydroxyprolin, zatímco zygomycety obsahují chitosan na svých buněčných stěnách. Další rozdíl mezi oomycety a zygomycety spočívá v tom, že vegetativní stav oomycet je diploidní, zatímco zygomycety jsou haploidní nebo dikaryotické.
Oomycety a zygomycety jsou mikroskopické eukaryotické organismy. Oomycety připomínají skutečné houby. Ale jsou to vodní formy. Zygomycety jsou jednou z hlavních tříd kmenů Zygomycota, což jsou pravé houby. Jsou to všudypřítomné, saprofytické, ekologické houby.