Klíčovým rozdílem mezi rezonancí a mezomerním účinkem je, že rezonance je výsledkem interakce mezi osamocenými elektronovými páry a vazebnými elektronovými páry, zatímco mezomerní účinek je výsledkem přítomnosti skupin substituentů nebo funkčních skupin.
Dva chemické pojmy rezonance a mezomerního účinku určují přesnou chemickou strukturu organické molekuly. Rezonance vzniká v molekulách, které mají osamocené elektronové páry na kterémkoli z atomů v molekule. Mezomerní účinek nastává, pokud má molekula substituenty nebo funkční skupiny. Oba tyto jevy jsou běžné v organických molekulách.
