Klíčovým rozdílem mezi klonovacím vektorem a expresním vektorem je to, že klonovací vektor nese cizí fragment DNA do hostitelské buňky, zatímco expresní vektor usnadňuje expresi genů do proteinů.
Vektor je důležitý termín v molekulární biologii. V technologii rekombinantní DNA je hlavní úlohou vektoru poskytnout způsob transportu k užitečné DNA frakci, která má být vložena do hostitelské buňky. Kromě toho se jedná o molekulu DNA, která se používá k umělému přenosu cizího fragmentu DNA do hostitelské buňky, aby byla exprimována nebo replikována. Nejpoužívanějšími vektory jsou plazmidy, virové vektory, kosmidy a umělé chromozomy. Klonovací vektor a expresní vektor jsou dva typy vektorů klasifikovaných na základě jejich aplikací.