Klíčovým rozdílem mezi přímou a nepřímou imunofluorescencí je, že přímá imunofluorescence používá jednu protilátku, která působí proti cílovému cíli, zatímco nepřímá imunofluorescence používá dvě protilátky k označení cílového cíle.
Imunofluorescence nebo buněčné zobrazování je technika, která se používá k označení specifického cílového antigenu fluoroforem. Zde je fluorofor fluorescenční chemická sloučenina, která může při světelné excitaci znovu emitovat světlo. Když se fluorofor váže na cílový antigen, umožňuje detekci cílové molekuly ve vzorku. Abychom to dále popsali, když se antigen váže na specifickou protilátku, může být konjugován s fluorofory. Při pozorování pod fluorescenčním mikroskopem je tedy snadné detekovat přítomnost cílového antigenu ve vzorku.
Kromě toho existují dva typy imunofluorescence; přímá a nepřímá imunofluorescence. Rozdíl mezi přímou a nepřímou imunofluorescencí spočívá hlavně v počtu použitých protilátek a konjugaci fluoroforů. To znamená, že v přímé imunofluorescenci se fluorofor přímo konjuguje s primární protilátkou, zatímco v nepřímé imunofluorescenci se fluorofor konjuguje se sekundární protilátkou.