Klíčovým rozdílem mezi ochranou in situ a ex situ je, že ochrana in-situ je metodou ochrany, která zahrnuje ochranu druhů na jejich obvyklých stanovištích, zatímco ochrana ex-situ je metodou ochrany, která zahrnuje ochranu druhů jinde mimo přirozené prostředí.
Zachování biologické rozmanitosti a genetických zdrojů je důležitým jevem. Ochrana biologické rozmanitosti a genetických zdrojů má hlavně dvě strategie. Lze to provést tak, že je necháte v jejich přirozeném prostředí, nebo je vezmete ven ze svých přirozených stanovišť a chráníte na jiných místech. V rámci ochrany in-situ se ochrana druhů odehrává na obvyklých nebo přirozených stanovištích. V ochraně ex-situ probíhá ochrana druhů na jiném místě mimo přirozené prostředí. Proto se tyto dvě metody v mnoha ohledech liší. Obě metody jsou však zásadní pro ochranu ohrožených nebo ohrožených druhů zvířat a rostlin.