Klíčovým rozdílem mezi mikronukleem a makronukleem je to, že mikronukleus je menší jádro, které obsahuje genom zárodečné linie nálevníků protozoanů, zatímco makronukleus je největším jádrem obsahujícím somatický genom nálevníků protilátků.
Jaderný dimorfismus je fenomén, kdy ve stejné buňce existují dva různé typy jader. Jedná se o speciální charakteristiku přítomnou v nálevnících nálevníků a některých foraminifera. Těmito dvěma jádry jsou makronukleus a mikronukleus. Obsahují samostatné genomy. Makronukleus je větší, který řídí metabolismus prvoků nálevníků, zatímco mikrojader je menší, který vykonává reprodukční funkce a generuje makronukleus.
