Klíčovým rozdílem mezi acetyl CoA a acyl CoA je to, že acetyl CoA (nebo acetyl koenzym A) pomáhá při metabolismu bílkovin, sacharidů a lipidů, zatímco acyl CoA (nebo acyl koenzym A) pomáhá při metabolismu mastných kyselin.
Acetyl CoA je velmi užitečný při dodávání acetylové skupiny do Krebsova cyklu pro výrobu energie. Acetylová skupina je funkční skupina, která má chemický vzorec -C (O) CH 3. Acylová skupina je také funkční skupina mající chemický vzorec –C (O) R, kde skupina R je postranní řetězec mastné kyseliny. Je užitečný při výrobě energie přeměnou na acetyl CoA.
