Klíčovým rozdílem mezi Pseudomonas aeruginosa a Pseudomonas fluorescens je, že P. aeruginosa je oportunistický lidský patogen, zatímco P. fluorescens není lidský patogen. Přesněji řečeno, P. aeruginosa je patogen rostlin a zvířat včetně člověka, zatímco P. fluorescence je růst rostlin podporující bakteriální druhy. Dalším důležitým rozdílem mezi Pseudomonas aeruginosa a Pseudomonas fluorescens je, že P. aeruginosa má schopnost růst i při 42 ° C.
Pseudomonas je bakteriální rod, který zahrnuje gramnegativní bakterie ve tvaru tyčinky a polární bičíky. Jsou to aerobní bakterie, které nevytvářejí spory, jsou pozitivní na katalázu a pozitivní na oxidázu. Kromě toho tento rod má mnoho druhů, včetně P. aeruginosa, P. fluorescens, P. putida, P. syringae atd.