Klíčovým rozdílem mezi auxinem a cytokininem je to, že auxin stimuluje větvení kořenů, zatímco cytokinin inhibuje větvení kořenů a tvorbu bočních kořenů. Aby toho nebylo málo, auxin je hlavně zodpovědný za prodloužení buněk ve špičkách stonků a kořenů, zatímco cytokininy jsou zodpovědné hlavně za dělení buněk, a proto se nacházejí v oblastech pěstování.
Fytohormony známé také jako rostlinné hormony jsou důležité chemické látky pro růst a vývoj rostlin. Jsou to organické molekuly a fungují jako signální molekuly, které regulují vývoj rostlin. Existuje pět hlavních typů rostlinných hormonů: auxin, giberelin, cytokinin, ethylen a kyselina abscisová. Provádějí tedy různé funkce samostatně a společně, aby ovlivnili růst rostlin.