Klíčovým rozdílem mezi polyatomovými ionty a sloučeninami je, že polyatomové ionty mají buď kladný nebo záporný elektrický náboj, zatímco sloučeniny nemají žádný čistý elektrický náboj.
Polyatomový iont je termín, který používáme k pojmenování chemických druhů obsahujících dva nebo více atomů, které mají čistý záporný nebo kladný elektrický náboj. Elektrický náboj tohoto iontu je výsledkem počtu elektronů přítomných v každém atomu; pokud existuje více elektronů než celkový počet protonů v atomech, získá čistý záporný náboj a naopak. Sloučeniny jsou naproti tomu chemické látky bez elektrického náboje. Mají stejný počet elektronů a protonů.