Klíčovým rozdílem mezi mikrospórami a pylovými zrny je, že mikrospory jsou malé spory, které se v rostlinách vyvinou do mužského gametofytu, zatímco pylové zrno je malé zrno, které obsahuje mužský gametofyt.
Reprodukce rostlin probíhá sexuálně i asexuálně, což ukazuje střídání generace. Existují dvě generace známé jako sporofytická generace a gametofytická generace. Mikrospory a pylové zrno jsou dvě struktury, které se vyvíjejí během těchto dvou generací. Microspore je struktura sporofytické generace, zatímco pylové zrno je struktura gametofytické generace. Mikroskop také není gametofyt, zatímco pylové zrno je gametofyt.
