Klíčovým rozdílem mezi bioreaktorem a fermentorem je typ biochemické reakce, která probíhá uvnitř uzavřených nádob. Bioreaktor podporuje všechny typy biochemických reakcí, ale fermentor podporuje pouze fermentaci.
Aplikace biotechnologie v průmyslu je zajímavou oblastí vědy. Tyto aplikace se liší od mikrobiálních aplikací až po aplikace na zvířatech. Kromě toho se průmyslové aplikace biotechnologií liší v hlavních oblastech, jako je zemědělství, medicína a různá průmyslová odvětví. Bioreaktory jsou uzavřené nádoby, ve kterých jsou vytvářeny podmínky nezbytné k usnadnění různých typů biochemických reakcí. Fermentory patří do skupiny bioreaktorů, ale zejména se jedná pouze o fermentaci.
