Klíčovým rozdílem mezi genotoxicitou a mutagenitou je, že genotoxicitou je schopnost látky způsobit toxicitu na DNA / genetickém materiálu buňky, zatímco mutagenicitou je schopnost látky způsobit mutace.
Genotoxicita a mutagenita jsou dva podobné výrazy, které lidé často nesprávně interpretují a zaměňují. Genotoxicita je toxický účinek vyvolaný chemickou látkou nebo látkou na geny nebo DNA buňky. Chemikálie, která má genotoxický účinek, je tedy genotoxin. Mutagenita je naopak schopnost látky vyvolat nebo vyvolat mutace. Genotoxická chemická látka nemusí být nutně mutagenní látkou. Mohou to být mutageny. Všechna mutagenní činidla jsou však genotoxická, protože mají schopnost ničit genetický materiál buňky.