Klíčovým rozdílem mezi primární a sekundární allylickou karbokací je, že primární allylická karbokace je méně stabilní než sekundární allylická karbokace.
Allylická karbokace je uhlíková struktura stabilizovaná rezonancí. Je to ion obsahující kladný náboj. V těchto iontech je kladný iont umístěn na allylickém atomu uhlíku (allylický atom uhlíku je sousedním atomem dvojné vazby). Primární allylická karbokace je allylická karbokace, kde je kladný náboj kladen na primární atom uhlíku, zatímco sekundární allylická karbokace je allylická karbokace, kde je kladný náboj umístěn na sekundárním atomu uhlíku.
