Klíčovým rozdílem mezi fenetikou a kladistikou je metoda používaná při klasifikaci organismů. Fenetika klasifikuje organismy na základě morfologických a strukturálních znaků, zatímco kladistika klasifikuje organismy na základě jejich předků a evolučních vztahů.
Klasifikace organismů je důležitým procesem v biologické rozmanitosti a biologických studiích. Taxonomie usnadňuje klasifikaci různých systémů a pomáhá při shlukování a seskupování organismů. V tomto ohledu hraje fenetika a kladistika důležitou roli při budování vztahů mezi organismy.
