Klíčový rozdíl mezi konfigurací R a S spočívá v tom, že konfigurace R je prostorové uspořádání R izomeru, který má relativní směr pořadí priorit ve směru hodinových ručiček, zatímco konfigurace S je prostorové uspořádání S izomeru, který má relativní směr priority pořadí proti směru hodinových ručiček. Zde je relativní směr pořadí priorit sestupné pořadí priorit substituentů.
R a S izomery jsou organické molekuly, které mají chirální centrum, což je atom uhlíku, který má k sobě připojené čtyři různé substituenty. Tyto substituenty jsou uvedeny podle jejich priority (priorita je určena pomocí pravidel CIP, jak je popsáno níže).
