Klíčový rozdíl mezi knockoutem genu a knockdownem spočívá v tom, že knock-out genu je technika, při které je sledovaný gen zcela odstraněn (inoperativní stav) ke studiu funkcí genu, zatímco knockdown genu je další technikou, při které je sledovaný gen umlčen k vyšetřování role konkrétního genu v biologickém systému.
Pro vyšetřování fungování genů v živých biologických systémech fungují různé genetické techniky. Genový knockout a knockdown jsou dvě takové techniky. Tyto techniky pomáhají vědcům identifikovat funkční aspekty různých genů v živých organismech.