Klíčový rozdíl mezi CFC a HCFC spočívá v tom, že CFC obsahuje pouze atomy uhlíku, fluoru a chloru, zatímco HCFC obsahuje atomy vodíku, uhlíku, fluoru a chloru. Ještě důležitější je, že CFC způsobuje vážné poškozování ozonu, ale HCFC má srovnatelně mnohem menší dopad na ozonovou vrstvu.
Chemické struktury CFC i HCFC se navzájem vztahují podle chemických prvků přítomných v těchto strukturách. Pokud jde o chemickou strukturu, rozdíl mezi CFC a HCFC spočívá v tom, že CFC nemá žádný atom vodíku, zatímco HCFC obsahuje atom vodíku. CFC je známý jako přispěvatel k úbytku ozonu. Jedná se tedy o škodlivou látku. HCFC je dobrou náhražkou této škodlivé látky.