Klíčovým rozdílem mezi peptidem a dipeptidem je to, že peptid je krátký řetězec aminokyselin, které se navzájem spojují prostřednictvím peptidových vazeb, zatímco dipeptid je forma peptidu, který má buď dvě aminokyseliny spojené s jednou peptidovou vazbou, nebo jednu aminokyselinu s dvě peptidové vazby.
Aminokyseliny jsou stavebními kameny bílkovin. Proto mezi sebou tvoří peptidové vazby a tvoří krátké řetězce aminokyselin; říkáme jim „peptidy“. Dlouhé a spojité peptidové řetězce jsou „polypeptidy“. Tyto polypeptidové řetězce se navzájem spojují za vzniku proteinů. Termín peptid je běžný termín, který používáme k pojmenování krátkého řetězce aminokyselin, ale pojem dipeptid je specifický termín, který používáme k pojmenování konkrétního typu peptidů.