Klíčovým rozdílem mezi alelou a genotypem je, že alela je jednou z variantních forem genu umístěných na stejném genetickém místě chromozomu, zatímco genotyp je genetickou konstitucí určitého znaku.
Genetika je studium genů a dědičných vzorců v organismech. Chromozomy jsou struktury, které obsahují genetickou informaci organismu. Proto u eukaryot existuje v genomu specifický počet chromozomů. Každý chromozom má tisíce genů, které jsou specifickými oblastmi chromozomů. Geny jsou ve skutečnosti strukturální jednotky v genetice, které uchovávají genetickou informaci za účelem produkce proteinů. Každý gen má dvě kopie pocházející od každého rodiče.
Podobně je alela variantou genu nebo formou genu. Kromě toho má každý gen dvě formy alel, které určují charakteristiku kódovanou genem. Genotyp je tedy genetická výbava organismu, která je určena distribucí alel v různých genech.
