Klíčovým rozdílem mezi E. coli a Klebsiellou je, že E. coli je gramnegativní bakterie ve tvaru tyčinky, která je pohyblivá, zatímco Klebsiella je rod gramnegativních bakterií ve tvaru tyčinky, který není pohyblivý.
Escherichia a Klebsiella jsou dva běžné rody koliformních bakterií. Oba rody se skládají z gramnegativních bakterií ve tvaru tyčinky, které nevytvářejí spory. E. coli je druh Escherichia. Je to pohyblivá koliformní bakterie ve výkalech. Bakterie E. coli i Klebsiella patří do čeledi Enterobacteriaceae. Jsou součástí normální flóry v našich střevech. Dále jsou to fakultativní anaeroby. Oba jsou obecně neškodné, ale v určitých situacích se stávají oportunistickými lidskými patogeny.
