Klíčovým rozdílem mezi ubichinony a cytochromy je, že ubichinony (CoQ) nejsou bílkoviny, zatímco cytochromy jsou bílkoviny.
Elektronový transportní řetězec je poslední fází aerobního dýchání. Proto se vyskytuje ve vnitřní membráně mitochondrií. Navíc se skládá z elektronových nosičů, které usnadňují produkci protonového gradientu přes membránu. Kromě NAD a flavoproteinů jsou ubichinony a cytochromy dva typy nosičů elektronů zapojených do řetězce přenosu elektronů. Ubichinony jsou hydrofobní organické molekuly nerozpustné v lipidech, které nejsou proteinové, zatímco cytochromy jsou proteiny obsahující železo.
