Klíčovým rozdílem mezi homozygotem a heterozygotem je, že homozygot znamená, že obě alely jsou podobné pro daný znak, zatímco heterozygot znamená, že tyto dvě alely jsou pro daný znak odlišné.
Geny zděděné z rodičovských chromozomů ovládají všechny znaky nebo rysy zvířat, rostlin a všech ostatních živých bytostí. To je hlavní důvod pro zobrazení rodičovských charakteristik v potomstvu. Většina eukaryotických organismů má dvě sady genů známých jako mateřské geny a otcovské geny. Proto je genetická situace známá jako diploidní (dvě sady chromozomů). To znamená; všechny vlastnosti mají genetické komponenty od matky i otce. Tyto geny však mohou být buď dominantní, nebo recesivní jeden nad druhým, a právě tam se stávají důležitými homozygotní a heterozygotní charakteristiky. Homozygot je stav mít dvě dominantní alely (AA) nebo dvě recesivní alely (aa), zatímco heterozygot je stav mít jednu dominantní alelu a jednu recesivní alelu (Aa).