Klíčovým rozdílem mezi dekantací a filtrací je to, že dekantace odděluje dvě složky ve směsi nalitím jedné složky, zatímco filtrace odděluje dvě složky odfiltrováním jedné složky.
Dekantace i filtrace oddělují dvě složky ve směsi kapalina-pevná látka nebo ve směsi dvou nemísitelných kapalin působením gravitační síly. Filtrace však pro tuto separaci používá filtrační papír nebo jiný vhodný filtr. Dekantace je však pouze odlévání kapaliny, aby se izolovala pevná látka nebo jiná kapalina ve směsi. Filtrace je tedy nejpřesnější metodou ze dvou, ale v některých případech je také užitečná dekantace.